Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED16Q9Y2X0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MED16Q9Y2X0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED16Q9Y2X0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED16Q9Y2X0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED16Q9Y2X0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED16Q9Y2X0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED16Q9Y2X0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED16Q9Y2X0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED16Q9Y2X0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED16Q9Y2X0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED16Q9Y2X0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED16Q9Y2X0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED16Q9Y2X0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED16Q9Y2X0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED16Q9Y2X0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED16Q9Y2X0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MED16Q9Y2X0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED16Q9Y2X0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED16Q9Y2X0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED16Q9Y2X0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED16Q9Y2X0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED16Q9Y2X0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED16Q9Y2X0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED16Q9Y2X0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MED16Q9Y2X0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED16Q9Y2X0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED16Q9Y2X0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED16Q9Y2X0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED16Q9Y2X0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MED16Q9Y2X0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MED16Q9Y2X0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms