Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
FZD1Q9UP38 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FZD1Q9UP38 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FZD1Q9UP38 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FZD1Q9UP38 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FZD1Q9UP38 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FZD1Q9UP38 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FZD1Q9UP38 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FZD1Q9UP38 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FZD1Q9UP38 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FZD1Q9UP38 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FZD1Q9UP38 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FZD1Q9UP38 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FZD1Q9UP38 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FZD1Q9UP38 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FZD1Q9UP38 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FZD1Q9UP38 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FZD1Q9UP38 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FZD1Q9UP38 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FZD1Q9UP38 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FZD1Q9UP38 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
FZD1Q9UP38 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FZD1Q9UP38 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FZD1Q9UP38 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FZD1Q9UP38 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FZD1Q9UP38 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FZD1Q9UP38 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
FZD1Q9UP38 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FZD1Q9UP38 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FZD1Q9UP38 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
FZD1Q9UP38 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
FZD1Q9UP38 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FZD1Q9UP38 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FZD1Q9UP38 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FZD1Q9UP38 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FZD1Q9UP38 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
FZD1Q9UP38 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FZD1Q9UP38 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FZD1Q9UP38 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FZD1Q9UP38 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FZD1Q9UP38 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FZD1Q9UP38 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FZD1Q9UP38 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FZD1Q9UP38 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
FZD1Q9UP38 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FZD1Q9UP38 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FZD1Q9UP38 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FZD1Q9UP38 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FZD1Q9UP38 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FZD1Q9UP38 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FZD1Q9UP38 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FZD1Q9UP38 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FZD1Q9UP38 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FZD1Q9UP38 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FZD1Q9UP38 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FZD1Q9UP38 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FZD1Q9UP38 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FZD1Q9UP38 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FZD1Q9UP38 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FZD1Q9UP38 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FZD1Q9UP38 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FZD1Q9UP38 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
FZD1Q9UP38 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FZD1Q9UP38 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FZD1Q9UP38 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FZD1Q9UP38 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FZD1Q9UP38 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FZD1Q9UP38 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FZD1Q9UP38 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FZD1Q9UP38 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FZD1Q9UP38 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FZD1Q9UP38 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FZD1Q9UP38 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FZD1Q9UP38 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FZD1Q9UP38 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FZD1Q9UP38 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FZD1Q9UP38 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FZD1Q9UP38 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FZD1Q9UP38 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FZD1Q9UP38 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FZD1Q9UP38 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FZD1Q9UP38 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FZD1Q9UP38 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FZD1Q9UP38 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FZD1Q9UP38 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FZD1Q9UP38 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FZD1Q9UP38 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FZD1Q9UP38 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FZD1Q9UP38 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FZD1Q9UP38 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FZD1Q9UP38 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FZD1Q9UP38 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FZD1Q9UP38 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FZD1Q9UP38 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FZD1Q9UP38 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FZD1Q9UP38 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FZD1Q9UP38 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FZD1Q9UP38 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FZD1Q9UP38 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FZD1Q9UP38 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms