Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TPCN1Q9ULQ1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TPCN1Q9ULQ1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TPCN1Q9ULQ1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TPCN1Q9ULQ1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TPCN1Q9ULQ1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TPCN1Q9ULQ1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TPCN1Q9ULQ1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TPCN1Q9ULQ1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TPCN1Q9ULQ1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TPCN1Q9ULQ1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TPCN1Q9ULQ1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TPCN1Q9ULQ1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TPCN1Q9ULQ1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TPCN1Q9ULQ1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TPCN1Q9ULQ1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TPCN1Q9ULQ1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TPCN1Q9ULQ1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TPCN1Q9ULQ1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TPCN1Q9ULQ1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TPCN1Q9ULQ1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TPCN1Q9ULQ1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TPCN1Q9ULQ1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TPCN1Q9ULQ1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TPCN1Q9ULQ1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TPCN1Q9ULQ1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TPCN1Q9ULQ1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TPCN1Q9ULQ1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TPCN1Q9ULQ1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TPCN1Q9ULQ1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TPCN1Q9ULQ1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TPCN1Q9ULQ1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TPCN1Q9ULQ1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TPCN1Q9ULQ1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TPCN1Q9ULQ1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TPCN1Q9ULQ1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TPCN1Q9ULQ1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TPCN1Q9ULQ1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TPCN1Q9ULQ1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TPCN1Q9ULQ1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TPCN1Q9ULQ1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TPCN1Q9ULQ1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TPCN1Q9ULQ1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TPCN1Q9ULQ1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TPCN1Q9ULQ1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TPCN1Q9ULQ1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TPCN1Q9ULQ1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TPCN1Q9ULQ1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TPCN1Q9ULQ1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TPCN1Q9ULQ1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TPCN1Q9ULQ1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TPCN1Q9ULQ1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TPCN1Q9ULQ1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms