Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM6

CNOT6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6Q9ULM6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNOT6Q9ULM6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNOT6Q9ULM6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNOT6Q9ULM6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNOT6Q9ULM6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNOT6Q9ULM6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNOT6Q9ULM6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNOT6Q9ULM6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT6Q9ULM6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT6Q9ULM6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT6Q9ULM6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNOT6Q9ULM6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CNOT6Q9ULM6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNOT6Q9ULM6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNOT6Q9ULM6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CNOT6Q9ULM6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT6Q9ULM6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT6Q9ULM6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT6Q9ULM6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT6Q9ULM6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT6Q9ULM6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT6Q9ULM6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNOT6Q9ULM6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNOT6Q9ULM6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNOT6Q9ULM6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNOT6Q9ULM6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNOT6Q9ULM6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNOT6Q9ULM6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNOT6Q9ULM6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNOT6Q9ULM6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNOT6Q9ULM6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNOT6Q9ULM6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNOT6Q9ULM6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms