Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK23

NAGPA, N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAGPAQ9UK23 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NAGPAQ9UK23 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NAGPAQ9UK23 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NAGPAQ9UK23 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NAGPAQ9UK23 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NAGPAQ9UK23 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NAGPAQ9UK23 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NAGPAQ9UK23 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NAGPAQ9UK23 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NAGPAQ9UK23 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NAGPAQ9UK23 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NAGPAQ9UK23 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NAGPAQ9UK23 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NAGPAQ9UK23 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NAGPAQ9UK23 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NAGPAQ9UK23 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NAGPAQ9UK23 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NAGPAQ9UK23 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NAGPAQ9UK23 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NAGPAQ9UK23 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NAGPAQ9UK23 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NAGPAQ9UK23 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NAGPAQ9UK23 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NAGPAQ9UK23 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NAGPAQ9UK23 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NAGPAQ9UK23 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NAGPAQ9UK23 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NAGPAQ9UK23 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NAGPAQ9UK23 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NAGPAQ9UK23 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NAGPAQ9UK23 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NAGPAQ9UK23 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NAGPAQ9UK23 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NAGPAQ9UK23 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NAGPAQ9UK23 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NAGPAQ9UK23 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NAGPAQ9UK23 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NAGPAQ9UK23 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NAGPAQ9UK23 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NAGPAQ9UK23 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NAGPAQ9UK23 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NAGPAQ9UK23 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NAGPAQ9UK23 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NAGPAQ9UK23 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NAGPAQ9UK23 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NAGPAQ9UK23 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NAGPAQ9UK23 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NAGPAQ9UK23 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NAGPAQ9UK23 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NAGPAQ9UK23 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms