Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGA2Q9UJY4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GGA2Q9UJY4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GGA2Q9UJY4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGA2Q9UJY4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGA2Q9UJY4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGA2Q9UJY4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGA2Q9UJY4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GGA2Q9UJY4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GGA2Q9UJY4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GGA2Q9UJY4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GGA2Q9UJY4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms