Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RHBDL2Q9NX52 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 597.3 ms