Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW7

C2orf42, Uncharacterized protein C2orf42, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf42Q9NWW7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C2orf42Q9NWW7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C2orf42Q9NWW7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C2orf42Q9NWW7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C2orf42Q9NWW7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C2orf42Q9NWW7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C2orf42Q9NWW7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C2orf42Q9NWW7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
C2orf42Q9NWW7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C2orf42Q9NWW7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C2orf42Q9NWW7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C2orf42Q9NWW7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C2orf42Q9NWW7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C2orf42Q9NWW7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C2orf42Q9NWW7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C2orf42Q9NWW7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C2orf42Q9NWW7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C2orf42Q9NWW7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C2orf42Q9NWW7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C2orf42Q9NWW7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C2orf42Q9NWW7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C2orf42Q9NWW7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C2orf42Q9NWW7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C2orf42Q9NWW7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C2orf42Q9NWW7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C2orf42Q9NWW7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C2orf42Q9NWW7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C2orf42Q9NWW7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C2orf42Q9NWW7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
C2orf42Q9NWW7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C2orf42Q9NWW7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C2orf42Q9NWW7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C2orf42Q9NWW7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C2orf42Q9NWW7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C2orf42Q9NWW7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C2orf42Q9NWW7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C2orf42Q9NWW7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C2orf42Q9NWW7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C2orf42Q9NWW7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C2orf42Q9NWW7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
C2orf42Q9NWW7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
C2orf42Q9NWW7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms