Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUD5

ZCCHC3, Zinc finger CCHC domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC3Q9NUD5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC3Q9NUD5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC3Q9NUD5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC3Q9NUD5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC3Q9NUD5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC3Q9NUD5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC3Q9NUD5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC3Q9NUD5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC3Q9NUD5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC3Q9NUD5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC3Q9NUD5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC3Q9NUD5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC3Q9NUD5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZCCHC3Q9NUD5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZCCHC3Q9NUD5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZCCHC3Q9NUD5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZCCHC3Q9NUD5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC3Q9NUD5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC3Q9NUD5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC3Q9NUD5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC3Q9NUD5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC3Q9NUD5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC3Q9NUD5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC3Q9NUD5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC3Q9NUD5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC3Q9NUD5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC3Q9NUD5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC3Q9NUD5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC3Q9NUD5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC3Q9NUD5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC3Q9NUD5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC3Q9NUD5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC3Q9NUD5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC3Q9NUD5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC3Q9NUD5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ZCCHC3Q9NUD5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZCCHC3Q9NUD5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC3Q9NUD5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms