Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD9

FARSB, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSBQ9NSD9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms