Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
HELLSQ9NRZ9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HELLSQ9NRZ9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HELLSQ9NRZ9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
HELLSQ9NRZ9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
HELLSQ9NRZ9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
HELLSQ9NRZ9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
HELLSQ9NRZ9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HELLSQ9NRZ9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HELLSQ9NRZ9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HELLSQ9NRZ9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HELLSQ9NRZ9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HELLSQ9NRZ9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HELLSQ9NRZ9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HELLSQ9NRZ9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HELLSQ9NRZ9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HELLSQ9NRZ9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HELLSQ9NRZ9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HELLSQ9NRZ9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
HELLSQ9NRZ9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HELLSQ9NRZ9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HELLSQ9NRZ9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HELLSQ9NRZ9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HELLSQ9NRZ9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HELLSQ9NRZ9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HELLSQ9NRZ9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HELLSQ9NRZ9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HELLSQ9NRZ9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HELLSQ9NRZ9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HELLSQ9NRZ9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HELLSQ9NRZ9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HELLSQ9NRZ9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HELLSQ9NRZ9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HELLSQ9NRZ9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HELLSQ9NRZ9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HELLSQ9NRZ9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
HELLSQ9NRZ9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
HELLSQ9NRZ9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HELLSQ9NRZ9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HELLSQ9NRZ9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HELLSQ9NRZ9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HELLSQ9NRZ9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
HELLSQ9NRZ9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HELLSQ9NRZ9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HELLSQ9NRZ9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HELLSQ9NRZ9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HELLSQ9NRZ9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HELLSQ9NRZ9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HELLSQ9NRZ9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HELLSQ9NRZ9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HELLSQ9NRZ9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HELLSQ9NRZ9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HELLSQ9NRZ9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
HELLSQ9NRZ9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
HELLSQ9NRZ9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HELLSQ9NRZ9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HELLSQ9NRZ9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
HELLSQ9NRZ9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HELLSQ9NRZ9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HELLSQ9NRZ9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HELLSQ9NRZ9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HELLSQ9NRZ9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HELLSQ9NRZ9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HELLSQ9NRZ9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HELLSQ9NRZ9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HELLSQ9NRZ9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HELLSQ9NRZ9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HELLSQ9NRZ9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HELLSQ9NRZ9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HELLSQ9NRZ9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HELLSQ9NRZ9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HELLSQ9NRZ9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HELLSQ9NRZ9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HELLSQ9NRZ9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HELLSQ9NRZ9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HELLSQ9NRZ9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HELLSQ9NRZ9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HELLSQ9NRZ9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HELLSQ9NRZ9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HELLSQ9NRZ9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HELLSQ9NRZ9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HELLSQ9NRZ9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HELLSQ9NRZ9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HELLSQ9NRZ9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HELLSQ9NRZ9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HELLSQ9NRZ9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HELLSQ9NRZ9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HELLSQ9NRZ9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
HELLSQ9NRZ9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HELLSQ9NRZ9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HELLSQ9NRZ9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HELLSQ9NRZ9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HELLSQ9NRZ9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HELLSQ9NRZ9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HELLSQ9NRZ9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HELLSQ9NRZ9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HELLSQ9NRZ9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HELLSQ9NRZ9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HELLSQ9NRZ9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HELLSQ9NRZ9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms