Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7T0

CATSPERB, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPERBQ9H7T0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CATSPERBQ9H7T0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CATSPERBQ9H7T0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CATSPERBQ9H7T0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CATSPERBQ9H7T0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CATSPERBQ9H7T0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CATSPERBQ9H7T0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CATSPERBQ9H7T0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms