Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A5Q9BY07 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A5Q9BY07 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A5Q9BY07 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A5Q9BY07 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A5Q9BY07 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A5Q9BY07 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A5Q9BY07 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A5Q9BY07 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A5Q9BY07 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A5Q9BY07 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A5Q9BY07 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A5Q9BY07 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A5Q9BY07 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A5Q9BY07 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A5Q9BY07 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A5Q9BY07 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A5Q9BY07 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A5Q9BY07 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A5Q9BY07 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A5Q9BY07 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A5Q9BY07 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A5Q9BY07 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A5Q9BY07 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A5Q9BY07 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A5Q9BY07 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A5Q9BY07 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A5Q9BY07 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A5Q9BY07 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A5Q9BY07 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A5Q9BY07 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A5Q9BY07 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A5Q9BY07 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A5Q9BY07 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A5Q9BY07 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A5Q9BY07 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A5Q9BY07 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A5Q9BY07 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A5Q9BY07 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A5Q9BY07 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A5Q9BY07 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A5Q9BY07 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A5Q9BY07 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A5Q9BY07 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A5Q9BY07 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A5Q9BY07 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A5Q9BY07 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A5Q9BY07 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A5Q9BY07 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A5Q9BY07 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A5Q9BY07 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A5Q9BY07 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A5Q9BY07 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A5Q9BY07 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A5Q9BY07 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A5Q9BY07 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A5Q9BY07 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A5Q9BY07 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC4A5Q9BY07 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A5Q9BY07 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A5Q9BY07 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A5Q9BY07 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A5Q9BY07 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A5Q9BY07 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A5Q9BY07 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A5Q9BY07 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A5Q9BY07 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A5Q9BY07 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A5Q9BY07 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A5Q9BY07 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A5Q9BY07 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A5Q9BY07 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A5Q9BY07 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A5Q9BY07 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A5Q9BY07 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A5Q9BY07 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A5Q9BY07 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A5Q9BY07 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A5Q9BY07 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A5Q9BY07 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A5Q9BY07 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A5Q9BY07 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A5Q9BY07 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A5Q9BY07 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A5Q9BY07 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A5Q9BY07 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A5Q9BY07 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A5Q9BY07 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A5Q9BY07 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A5Q9BY07 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A5Q9BY07 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A5Q9BY07 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A5Q9BY07 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A5Q9BY07 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A5Q9BY07 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A5Q9BY07 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A5Q9BY07 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A5Q9BY07 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A5Q9BY07 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC4A5Q9BY07 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms