Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
BRIP1Q9BX63 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BRIP1Q9BX63 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BRIP1Q9BX63 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BRIP1Q9BX63 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
BRIP1Q9BX63 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
BRIP1Q9BX63 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRIP1Q9BX63 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRIP1Q9BX63 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRIP1Q9BX63 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRIP1Q9BX63 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRIP1Q9BX63 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRIP1Q9BX63 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BRIP1Q9BX63 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BRIP1Q9BX63 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BRIP1Q9BX63 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
BRIP1Q9BX63 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BRIP1Q9BX63 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BRIP1Q9BX63 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BRIP1Q9BX63 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BRIP1Q9BX63 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BRIP1Q9BX63 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BRIP1Q9BX63 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BRIP1Q9BX63 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
BRIP1Q9BX63 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
BRIP1Q9BX63 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
BRIP1Q9BX63 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
BRIP1Q9BX63 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
BRIP1Q9BX63 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BRIP1Q9BX63 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BRIP1Q9BX63 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
BRIP1Q9BX63 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
BRIP1Q9BX63 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
BRIP1Q9BX63 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BRIP1Q9BX63 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BRIP1Q9BX63 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BRIP1Q9BX63 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BRIP1Q9BX63 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BRIP1Q9BX63 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BRIP1Q9BX63 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
BRIP1Q9BX63 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BRIP1Q9BX63 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
BRIP1Q9BX63 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
BRIP1Q9BX63 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
BRIP1Q9BX63 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BRIP1Q9BX63 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
BRIP1Q9BX63 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
BRIP1Q9BX63 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
BRIP1Q9BX63 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
BRIP1Q9BX63 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
BRIP1Q9BX63 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
BRIP1Q9BX63 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BRIP1Q9BX63 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
BRIP1Q9BX63 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
BRIP1Q9BX63 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BRIP1Q9BX63 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BRIP1Q9BX63 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BRIP1Q9BX63 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms