Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUE0

MED18, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 18, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED18Q9BUE0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED18Q9BUE0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED18Q9BUE0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED18Q9BUE0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED18Q9BUE0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED18Q9BUE0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED18Q9BUE0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED18Q9BUE0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MED18Q9BUE0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED18Q9BUE0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED18Q9BUE0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED18Q9BUE0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED18Q9BUE0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED18Q9BUE0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED18Q9BUE0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED18Q9BUE0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED18Q9BUE0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED18Q9BUE0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED18Q9BUE0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED18Q9BUE0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED18Q9BUE0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MED18Q9BUE0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED18Q9BUE0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED18Q9BUE0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED18Q9BUE0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED18Q9BUE0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED18Q9BUE0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED18Q9BUE0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MED18Q9BUE0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MED18Q9BUE0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MED18Q9BUE0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MED18Q9BUE0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED18Q9BUE0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED18Q9BUE0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MED18Q9BUE0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED18Q9BUE0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED18Q9BUE0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED18Q9BUE0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED18Q9BUE0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED18Q9BUE0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED18Q9BUE0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED18Q9BUE0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED18Q9BUE0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED18Q9BUE0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED18Q9BUE0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MED18Q9BUE0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED18Q9BUE0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED18Q9BUE0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED18Q9BUE0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED18Q9BUE0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED18Q9BUE0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED18Q9BUE0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED18Q9BUE0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED18Q9BUE0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED18Q9BUE0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms