Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRD0

BUD13, BUD13 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 619 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD13Q9BRD0 C8orf33-202ENST00000524395 1125 ntTSL 1 (best)20.63■□□□□ 0.891e-8■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 LRP5-207ENST00000533695 267 ntTSL 320.4■□□□□ 0.861e-8■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 CCNF-203ENST00000564236 789 ntTSL 319.59■□□□□ 0.731e-8■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.74e-13■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.631e-8■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 C8orf33-205ENST00000534350 1329 ntTSL 418.94■□□□□ 0.621e-8■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.595e-9■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 ARF1-202ENST00000469235 678 ntTSL 318.16■□□□□ 0.55e-9■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 ARF1-212ENST00000497165 675 ntTSL 317.59■□□□□ 0.415e-9■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 ARF1-203ENST00000470558 820 ntTSL 217.59■□□□□ 0.415e-9■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.361e-8■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 C8orf33-204ENST00000530455 2676 ntTSL 1 (best)17.26■□□□□ 0.351e-8■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.31e-8■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.292e-13■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 ARF1-210ENST00000482962 597 ntTSL 316.78■□□□□ 0.285e-9■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 ARF1-204ENST00000470670 712 ntTSL 316.3■□□□□ 0.25e-9■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.161e-8■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.062e-13■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.052e-13■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.021e-8■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 ALOX5-207ENST00000542434 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.151e-8■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 ALOX5-208ENST00000612635 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.171e-8■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 ALOX5-201ENST00000374391 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.191e-8■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 COPG1-208ENST00000513965 730 ntTSL 213.57□□□□□ -0.241e-8■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 ATG9A-203ENST00000409033 3701 ntTSL 1 (best)13.43□□□□□ -0.262e-13■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 ATG9A-208ENST00000429920 733 ntTSL 513.29□□□□□ -0.281e-8■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 ARF1-201ENST00000272102 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.55e-9■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 ATG9A-202ENST00000396761 3799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.542e-13■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 TAMM41-206ENST00000455809 1213 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.561e-8■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 PITPNM1-209ENST00000527370 3712 ntTSL 211.1□□□□□ -0.631e-8■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 TAMM41-209ENST00000486090 2768 ntTSL 29.92□□□□□ -0.821e-8■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 TAMM41-203ENST00000414736 648 ntTSL 39.72□□□□□ -0.851e-8■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 TAMM41-211ENST00000498127 746 ntTSL 29.72□□□□□ -0.851e-8■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 ALOX5-202ENST00000475300 446 ntTSL 29.45□□□□□ -0.91e-8■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 TAMM41-207ENST00000457498 2558 ntTSL 29.33□□□□□ -0.921e-8■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 EIF2AK3-206ENST00000478003 666 ntTSL 48.46□□□□□ -1.061e-8■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 EIF2AK3-202ENST00000415570 2902 ntTSL 1 (best)5.68□□□□□ -1.54e-13■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.554e-13■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 EIF2AK3-204ENST00000470706 582 ntTSL 35.32□□□□□ -1.561e-8■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 MED1-205ENST00000584308 467 ntTSL 24.9□□□□□ -1.631e-8■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.914e-9■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.672e-6■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 TRMU-204ENST00000441818 1793 ntTSL 1 (best)22.43■■□□□ 1.182e-7■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 TRMU-207ENST00000457572 1882 ntTSL 222.15■■□□□ 1.142e-7■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 TRMU-206ENST00000456595 1688 ntTSL 1 (best)21.69■■□□□ 1.062e-7■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.052e-7■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 TRMU-205ENST00000453630 1775 ntTSL 221.56■■□□□ 1.042e-7■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 TRMU-203ENST00000381021 1830 ntTSL 221.48■■□□□ 1.032e-7■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.982e-7■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 TRMU-216ENST00000491612 2933 ntTSL 215.94■□□□□ 0.145e-8■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 TRMU-214ENST00000485559 2653 ntTSL 215.42■□□□□ 0.065e-8■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.091e-10■■■■■ 30.6
BUD13Q9BRD0 HINT1-204ENST00000506908 681 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.131e-10■■■■■ 30.6
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BUD13Q9BRD0 HINT1-210ENST00000520028 82 ntTSL 36.52□□□□□ -1.371e-10■■■■■ 30.6
BUD13Q9BRD0 SYNJ1-205ENST00000429236 2212 ntTSL 1 (best)20.86■□□□□ 0.931e-8■■■■■ 30.6
BUD13Q9BRD0 SYNJ1-202ENST00000382491 6958 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.671e-8■■■■■ 30.6
BUD13Q9BRD0 SYNJ1-203ENST00000382499 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.711e-8■■■■■ 30.6
BUD13Q9BRD0 SYNJ1-201ENST00000357345 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.711e-8■■■■■ 30.6
BUD13Q9BRD0 SYNJ1-211ENST00000630077 6898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.741e-8■■■■■ 30.6
BUD13Q9BRD0 SYNJ1-206ENST00000433931 4852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.761e-8■■■■■ 30.6
BUD13Q9BRD0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.556e-8■■■■■ 30.6
BUD13Q9BRD0 LDLRAP1-205ENST00000484476 657 ntTSL 1 (best)16.03■□□□□ 0.166e-8■■■■■ 30.6
BUD13Q9BRD0 LDLRAP1-204ENST00000474283 913 ntTSL 314.78□□□□□ -0.046e-8■■■■■ 30.6
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BUD13Q9BRD0 ELP3-209ENST00000520288 566 ntTSL 414.09□□□□□ -0.151e-8■■■■■ 30.6
BUD13Q9BRD0 DIS3L2-210ENST00000433430 4671 ntTSL 514.01□□□□□ -0.171e-8■■■■■ 30.6
BUD13Q9BRD0 DIS3L2-209ENST00000429283 4332 ntTSL 212.28□□□□□ -0.441e-8■■■■■ 30.6
BUD13Q9BRD0 DIS3L2-201ENST00000273009 3201 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.451e-8■■■■■ 30.6
BUD13Q9BRD0 DIS3L2-213ENST00000445090 3250 ntTSL 1 (best)11.85□□□□□ -0.511e-8■■■■■ 30.6
BUD13Q9BRD0 DIS3L2-204ENST00000409307 2658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.521e-8■■■■■ 30.6
BUD13Q9BRD0 ELP3-213ENST00000521938 1004 ntTSL 210.96□□□□□ -0.651e-8■■■■■ 30.6
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BUD13Q9BRD0 DIS3L2-203ENST00000390005 3328 ntTSL 1 (best)10.18□□□□□ -0.781e-8■■■■■ 30.6
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BUD13Q9BRD0 ELP3-208ENST00000520270 545 ntTSL 46.28□□□□□ -1.41e-8■■■■■ 30.6
BUD13Q9BRD0 ELP3-211ENST00000521099 545 ntTSL 45.52□□□□□ -1.531e-8■■■■■ 30.6
BUD13Q9BRD0 IFRD2-214ENST00000489569 1036 ntTSL 518.71■□□□□ 0.594e-7■■■■■ 30.5
BUD13Q9BRD0 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.072e-7■■■■■ 30.5
BUD13Q9BRD0 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.052e-7■■■■■ 30.5
BUD13Q9BRD0 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -02e-7■■■■■ 30.5
BUD13Q9BRD0 FAM13A-220ENST00000513837 2590 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.667e-7■■■■■ 30.4
BUD13Q9BRD0 FAM13A-212ENST00000508369 3169 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.787e-7■■■■■ 30.4
BUD13Q9BRD0 FAM13A-218ENST00000511976 3579 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.987e-7■■■■■ 30.4
BUD13Q9BRD0 FAM13A-202ENST00000395002 4945 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.997e-7■■■■■ 30.4
BUD13Q9BRD0 FAM13A-201ENST00000264344 5858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -17e-7■■■■■ 30.4
BUD13Q9BRD0 FAM13A-205ENST00000503556 3386 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.047e-7■■■■■ 30.4
BUD13Q9BRD0 CHST15-205ENST00000628426 3553 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.448e-9■■■■■ 30.3
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BUD13Q9BRD0 GALT-225ENST00000556403 568 ntTSL 417.02■□□□□ 0.323e-7■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.36e-8■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.136e-8■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 MKS1-213ENST00000585134 824 ntTSL 215.79■□□□□ 0.126e-8■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 MKS1-211ENST00000581761 812 ntTSL 315.54■□□□□ 0.086e-8■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 MKS1-203ENST00000393120 1926 ntTSL 215.45■□□□□ 0.066e-8■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.026e-8■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 MKS1-206ENST00000577824 1158 ntTSL 513.94□□□□□ -0.186e-8■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 GALT-204ENST00000468099 551 ntTSL 411.66□□□□□ -0.543e-7■■■■■ 30.2
Retrieved 100 of 53,381 protein–RNA pairs in 4238.2 ms