Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
YME1L1Q96TA2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
YME1L1Q96TA2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
YME1L1Q96TA2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
YME1L1Q96TA2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
YME1L1Q96TA2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
YME1L1Q96TA2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
YME1L1Q96TA2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
YME1L1Q96TA2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
YME1L1Q96TA2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
YME1L1Q96TA2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
YME1L1Q96TA2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
YME1L1Q96TA2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
YME1L1Q96TA2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
YME1L1Q96TA2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
YME1L1Q96TA2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
YME1L1Q96TA2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
YME1L1Q96TA2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
YME1L1Q96TA2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
YME1L1Q96TA2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
YME1L1Q96TA2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
YME1L1Q96TA2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
YME1L1Q96TA2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
YME1L1Q96TA2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
YME1L1Q96TA2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
YME1L1Q96TA2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
YME1L1Q96TA2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
YME1L1Q96TA2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
YME1L1Q96TA2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
YME1L1Q96TA2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
YME1L1Q96TA2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
YME1L1Q96TA2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
YME1L1Q96TA2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
YME1L1Q96TA2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
YME1L1Q96TA2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
YME1L1Q96TA2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
YME1L1Q96TA2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
YME1L1Q96TA2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
YME1L1Q96TA2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
YME1L1Q96TA2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
YME1L1Q96TA2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
YME1L1Q96TA2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
YME1L1Q96TA2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
YME1L1Q96TA2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
YME1L1Q96TA2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
YME1L1Q96TA2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
YME1L1Q96TA2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
YME1L1Q96TA2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
YME1L1Q96TA2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
YME1L1Q96TA2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
YME1L1Q96TA2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
YME1L1Q96TA2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms