Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UHRF1Q96T88 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UHRF1Q96T88 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UHRF1Q96T88 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UHRF1Q96T88 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UHRF1Q96T88 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UHRF1Q96T88 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UHRF1Q96T88 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UHRF1Q96T88 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UHRF1Q96T88 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UHRF1Q96T88 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UHRF1Q96T88 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UHRF1Q96T88 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UHRF1Q96T88 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UHRF1Q96T88 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
UHRF1Q96T88 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UHRF1Q96T88 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UHRF1Q96T88 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UHRF1Q96T88 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UHRF1Q96T88 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
UHRF1Q96T88 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UHRF1Q96T88 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UHRF1Q96T88 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UHRF1Q96T88 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UHRF1Q96T88 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UHRF1Q96T88 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
UHRF1Q96T88 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UHRF1Q96T88 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UHRF1Q96T88 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UHRF1Q96T88 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UHRF1Q96T88 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UHRF1Q96T88 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UHRF1Q96T88 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
UHRF1Q96T88 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UHRF1Q96T88 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UHRF1Q96T88 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UHRF1Q96T88 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UHRF1Q96T88 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UHRF1Q96T88 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UHRF1Q96T88 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UHRF1Q96T88 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UHRF1Q96T88 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UHRF1Q96T88 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UHRF1Q96T88 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UHRF1Q96T88 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UHRF1Q96T88 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UHRF1Q96T88 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UHRF1Q96T88 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UHRF1Q96T88 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UHRF1Q96T88 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UHRF1Q96T88 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UHRF1Q96T88 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UHRF1Q96T88 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UHRF1Q96T88 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UHRF1Q96T88 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UHRF1Q96T88 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UHRF1Q96T88 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UHRF1Q96T88 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UHRF1Q96T88 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UHRF1Q96T88 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UHRF1Q96T88 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
UHRF1Q96T88 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UHRF1Q96T88 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UHRF1Q96T88 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UHRF1Q96T88 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UHRF1Q96T88 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UHRF1Q96T88 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UHRF1Q96T88 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
UHRF1Q96T88 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UHRF1Q96T88 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UHRF1Q96T88 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UHRF1Q96T88 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UHRF1Q96T88 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UHRF1Q96T88 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
UHRF1Q96T88 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UHRF1Q96T88 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UHRF1Q96T88 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms