Protein–RNA interactions for Protein: Q96QP1

ALPK1, Alpha-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK1Q96QP1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALPK1Q96QP1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALPK1Q96QP1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALPK1Q96QP1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALPK1Q96QP1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ALPK1Q96QP1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALPK1Q96QP1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALPK1Q96QP1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ALPK1Q96QP1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALPK1Q96QP1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALPK1Q96QP1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALPK1Q96QP1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALPK1Q96QP1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALPK1Q96QP1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALPK1Q96QP1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALPK1Q96QP1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALPK1Q96QP1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALPK1Q96QP1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ALPK1Q96QP1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALPK1Q96QP1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALPK1Q96QP1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALPK1Q96QP1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALPK1Q96QP1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALPK1Q96QP1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALPK1Q96QP1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALPK1Q96QP1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALPK1Q96QP1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALPK1Q96QP1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALPK1Q96QP1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALPK1Q96QP1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALPK1Q96QP1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALPK1Q96QP1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALPK1Q96QP1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALPK1Q96QP1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALPK1Q96QP1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALPK1Q96QP1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALPK1Q96QP1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALPK1Q96QP1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALPK1Q96QP1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALPK1Q96QP1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms