Protein–RNA interactions for Protein: Q96N96

SPATA13, Spermatogenesis-associated protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA13Q96N96 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPATA13Q96N96 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPATA13Q96N96 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPATA13Q96N96 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SPATA13Q96N96 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPATA13Q96N96 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.7 ms