Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXH5

SOCS4, Suppressor of cytokine signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS4Q8WXH5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SOCS4Q8WXH5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SOCS4Q8WXH5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOCS4Q8WXH5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOCS4Q8WXH5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOCS4Q8WXH5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOCS4Q8WXH5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SOCS4Q8WXH5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOCS4Q8WXH5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOCS4Q8WXH5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SOCS4Q8WXH5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SOCS4Q8WXH5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SOCS4Q8WXH5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SOCS4Q8WXH5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SOCS4Q8WXH5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SOCS4Q8WXH5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SOCS4Q8WXH5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SOCS4Q8WXH5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SOCS4Q8WXH5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SOCS4Q8WXH5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SOCS4Q8WXH5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SOCS4Q8WXH5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOCS4Q8WXH5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOCS4Q8WXH5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOCS4Q8WXH5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SOCS4Q8WXH5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOCS4Q8WXH5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOCS4Q8WXH5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOCS4Q8WXH5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SOCS4Q8WXH5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SOCS4Q8WXH5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SOCS4Q8WXH5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SOCS4Q8WXH5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SOCS4Q8WXH5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SOCS4Q8WXH5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SOCS4Q8WXH5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SOCS4Q8WXH5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SOCS4Q8WXH5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SOCS4Q8WXH5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SOCS4Q8WXH5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SOCS4Q8WXH5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SOCS4Q8WXH5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SOCS4Q8WXH5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SOCS4Q8WXH5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SOCS4Q8WXH5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SOCS4Q8WXH5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SOCS4Q8WXH5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SOCS4Q8WXH5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SOCS4Q8WXH5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SOCS4Q8WXH5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SOCS4Q8WXH5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SOCS4Q8WXH5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SOCS4Q8WXH5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SOCS4Q8WXH5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SOCS4Q8WXH5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SOCS4Q8WXH5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SOCS4Q8WXH5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SOCS4Q8WXH5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SOCS4Q8WXH5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SOCS4Q8WXH5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SOCS4Q8WXH5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SOCS4Q8WXH5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SOCS4Q8WXH5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SOCS4Q8WXH5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOCS4Q8WXH5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOCS4Q8WXH5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOCS4Q8WXH5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOCS4Q8WXH5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SOCS4Q8WXH5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOCS4Q8WXH5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SOCS4Q8WXH5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SOCS4Q8WXH5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SOCS4Q8WXH5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SOCS4Q8WXH5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SOCS4Q8WXH5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SOCS4Q8WXH5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SOCS4Q8WXH5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SOCS4Q8WXH5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SOCS4Q8WXH5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SOCS4Q8WXH5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SOCS4Q8WXH5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SOCS4Q8WXH5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SOCS4Q8WXH5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SOCS4Q8WXH5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SOCS4Q8WXH5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SOCS4Q8WXH5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SOCS4Q8WXH5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOCS4Q8WXH5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOCS4Q8WXH5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOCS4Q8WXH5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOCS4Q8WXH5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOCS4Q8WXH5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOCS4Q8WXH5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOCS4Q8WXH5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOCS4Q8WXH5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOCS4Q8WXH5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOCS4Q8WXH5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOCS4Q8WXH5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOCS4Q8WXH5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOCS4Q8WXH5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms