Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBOF1Q8ND07 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBOF1Q8ND07 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBOF1Q8ND07 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BBOF1Q8ND07 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BBOF1Q8ND07 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBOF1Q8ND07 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BBOF1Q8ND07 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BBOF1Q8ND07 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BBOF1Q8ND07 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BBOF1Q8ND07 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BBOF1Q8ND07 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BBOF1Q8ND07 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BBOF1Q8ND07 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BBOF1Q8ND07 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BBOF1Q8ND07 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BBOF1Q8ND07 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BBOF1Q8ND07 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BBOF1Q8ND07 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BBOF1Q8ND07 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BBOF1Q8ND07 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BBOF1Q8ND07 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BBOF1Q8ND07 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BBOF1Q8ND07 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BBOF1Q8ND07 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BBOF1Q8ND07 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BBOF1Q8ND07 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBOF1Q8ND07 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBOF1Q8ND07 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BBOF1Q8ND07 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBOF1Q8ND07 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBOF1Q8ND07 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBOF1Q8ND07 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BBOF1Q8ND07 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BBOF1Q8ND07 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BBOF1Q8ND07 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BBOF1Q8ND07 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BBOF1Q8ND07 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBOF1Q8ND07 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBOF1Q8ND07 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBOF1Q8ND07 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBOF1Q8ND07 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBOF1Q8ND07 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBOF1Q8ND07 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBOF1Q8ND07 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BBOF1Q8ND07 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms