Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
BBOF1Q8ND07 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
BBOF1Q8ND07 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
BBOF1Q8ND07 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
BBOF1Q8ND07 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
BBOF1Q8ND07 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
BBOF1Q8ND07 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
BBOF1Q8ND07 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
BBOF1Q8ND07 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
BBOF1Q8ND07 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
BBOF1Q8ND07 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
BBOF1Q8ND07 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
BBOF1Q8ND07 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
BBOF1Q8ND07 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
BBOF1Q8ND07 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
BBOF1Q8ND07 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
BBOF1Q8ND07 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
BBOF1Q8ND07 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
BBOF1Q8ND07 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
BBOF1Q8ND07 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
BBOF1Q8ND07 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
BBOF1Q8ND07 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
BBOF1Q8ND07 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
BBOF1Q8ND07 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
BBOF1Q8ND07 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
BBOF1Q8ND07 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
BBOF1Q8ND07 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
BBOF1Q8ND07 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
BBOF1Q8ND07 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
BBOF1Q8ND07 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
BBOF1Q8ND07 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
BBOF1Q8ND07 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
BBOF1Q8ND07 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
BBOF1Q8ND07 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
BBOF1Q8ND07 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
BBOF1Q8ND07 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
BBOF1Q8ND07 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
BBOF1Q8ND07 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
BBOF1Q8ND07 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
BBOF1Q8ND07 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
BBOF1Q8ND07 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
BBOF1Q8ND07 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
BBOF1Q8ND07 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
BBOF1Q8ND07 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
BBOF1Q8ND07 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
BBOF1Q8ND07 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
BBOF1Q8ND07 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
BBOF1Q8ND07 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
BBOF1Q8ND07 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
BBOF1Q8ND07 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
BBOF1Q8ND07 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
BBOF1Q8ND07 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
BBOF1Q8ND07 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
BBOF1Q8ND07 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
BBOF1Q8ND07 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
BBOF1Q8ND07 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
BBOF1Q8ND07 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
BBOF1Q8ND07 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
BBOF1Q8ND07 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
BBOF1Q8ND07 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
BBOF1Q8ND07 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
BBOF1Q8ND07 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
BBOF1Q8ND07 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
BBOF1Q8ND07 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
BBOF1Q8ND07 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
BBOF1Q8ND07 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
BBOF1Q8ND07 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
BBOF1Q8ND07 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
BBOF1Q8ND07 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
BBOF1Q8ND07 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
BBOF1Q8ND07 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
BBOF1Q8ND07 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
BBOF1Q8ND07 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
BBOF1Q8ND07 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
BBOF1Q8ND07 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
BBOF1Q8ND07 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BBOF1Q8ND07 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BBOF1Q8ND07 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
BBOF1Q8ND07 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
BBOF1Q8ND07 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
BBOF1Q8ND07 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
BBOF1Q8ND07 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
BBOF1Q8ND07 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
BBOF1Q8ND07 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
BBOF1Q8ND07 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
BBOF1Q8ND07 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BBOF1Q8ND07 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BBOF1Q8ND07 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BBOF1Q8ND07 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
BBOF1Q8ND07 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BBOF1Q8ND07 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
BBOF1Q8ND07 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
BBOF1Q8ND07 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BBOF1Q8ND07 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BBOF1Q8ND07 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BBOF1Q8ND07 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BBOF1Q8ND07 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BBOF1Q8ND07 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BBOF1Q8ND07 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
BBOF1Q8ND07 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms