Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOT1Q8IXI2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOT1Q8IXI2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOT1Q8IXI2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOT1Q8IXI2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOT1Q8IXI2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOT1Q8IXI2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOT1Q8IXI2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOT1Q8IXI2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOT1Q8IXI2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOT1Q8IXI2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOT1Q8IXI2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOT1Q8IXI2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOT1Q8IXI2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOT1Q8IXI2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOT1Q8IXI2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RHOT1Q8IXI2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms