Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5N4

SDK1, Protein sidekick-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK1Q7Z5N4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SDK1Q7Z5N4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDK1Q7Z5N4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDK1Q7Z5N4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDK1Q7Z5N4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDK1Q7Z5N4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDK1Q7Z5N4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDK1Q7Z5N4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDK1Q7Z5N4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDK1Q7Z5N4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDK1Q7Z5N4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDK1Q7Z5N4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SDK1Q7Z5N4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDK1Q7Z5N4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDK1Q7Z5N4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDK1Q7Z5N4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDK1Q7Z5N4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDK1Q7Z5N4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDK1Q7Z5N4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDK1Q7Z5N4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDK1Q7Z5N4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDK1Q7Z5N4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SDK1Q7Z5N4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDK1Q7Z5N4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDK1Q7Z5N4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDK1Q7Z5N4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDK1Q7Z5N4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDK1Q7Z5N4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDK1Q7Z5N4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDK1Q7Z5N4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SDK1Q7Z5N4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDK1Q7Z5N4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDK1Q7Z5N4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDK1Q7Z5N4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDK1Q7Z5N4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDK1Q7Z5N4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDK1Q7Z5N4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SDK1Q7Z5N4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDK1Q7Z5N4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SDK1Q7Z5N4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDK1Q7Z5N4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDK1Q7Z5N4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SDK1Q7Z5N4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDK1Q7Z5N4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDK1Q7Z5N4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDK1Q7Z5N4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDK1Q7Z5N4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDK1Q7Z5N4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDK1Q7Z5N4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDK1Q7Z5N4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDK1Q7Z5N4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDK1Q7Z5N4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SDK1Q7Z5N4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SDK1Q7Z5N4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SDK1Q7Z5N4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDK1Q7Z5N4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms