Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTF1AQ7RTS3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTF1AQ7RTS3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTF1AQ7RTS3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTF1AQ7RTS3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTF1AQ7RTS3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTF1AQ7RTS3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTF1AQ7RTS3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTF1AQ7RTS3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTF1AQ7RTS3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTF1AQ7RTS3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTF1AQ7RTS3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
PTF1AQ7RTS3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PTF1AQ7RTS3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PTF1AQ7RTS3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTF1AQ7RTS3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTF1AQ7RTS3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTF1AQ7RTS3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTF1AQ7RTS3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTF1AQ7RTS3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
PTF1AQ7RTS3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTF1AQ7RTS3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
PTF1AQ7RTS3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTF1AQ7RTS3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTF1AQ7RTS3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTF1AQ7RTS3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTF1AQ7RTS3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTF1AQ7RTS3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTF1AQ7RTS3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTF1AQ7RTS3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTF1AQ7RTS3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTF1AQ7RTS3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTF1AQ7RTS3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTF1AQ7RTS3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTF1AQ7RTS3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTF1AQ7RTS3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTF1AQ7RTS3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
PTF1AQ7RTS3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTF1AQ7RTS3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTF1AQ7RTS3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTF1AQ7RTS3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTF1AQ7RTS3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTF1AQ7RTS3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTF1AQ7RTS3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTF1AQ7RTS3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTF1AQ7RTS3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTF1AQ7RTS3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PTF1AQ7RTS3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTF1AQ7RTS3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTF1AQ7RTS3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTF1AQ7RTS3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTF1AQ7RTS3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTF1AQ7RTS3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTF1AQ7RTS3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTF1AQ7RTS3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTF1AQ7RTS3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTF1AQ7RTS3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
PTF1AQ7RTS3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTF1AQ7RTS3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
PTF1AQ7RTS3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTF1AQ7RTS3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTF1AQ7RTS3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTF1AQ7RTS3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTF1AQ7RTS3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTF1AQ7RTS3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTF1AQ7RTS3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTF1AQ7RTS3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTF1AQ7RTS3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
PTF1AQ7RTS3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTF1AQ7RTS3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTF1AQ7RTS3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTF1AQ7RTS3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTF1AQ7RTS3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTF1AQ7RTS3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTF1AQ7RTS3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTF1AQ7RTS3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
PTF1AQ7RTS3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTF1AQ7RTS3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTF1AQ7RTS3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTF1AQ7RTS3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTF1AQ7RTS3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
PTF1AQ7RTS3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
PTF1AQ7RTS3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTF1AQ7RTS3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTF1AQ7RTS3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTF1AQ7RTS3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTF1AQ7RTS3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
PTF1AQ7RTS3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTF1AQ7RTS3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTF1AQ7RTS3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTF1AQ7RTS3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTF1AQ7RTS3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTF1AQ7RTS3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
PTF1AQ7RTS3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTF1AQ7RTS3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTF1AQ7RTS3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTF1AQ7RTS3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTF1AQ7RTS3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTF1AQ7RTS3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTF1AQ7RTS3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms