Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TPTE2Q6XPS3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TPTE2Q6XPS3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TPTE2Q6XPS3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TPTE2Q6XPS3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TPTE2Q6XPS3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TPTE2Q6XPS3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TPTE2Q6XPS3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TPTE2Q6XPS3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TPTE2Q6XPS3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TPTE2Q6XPS3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TPTE2Q6XPS3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TPTE2Q6XPS3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TPTE2Q6XPS3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TPTE2Q6XPS3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TPTE2Q6XPS3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TPTE2Q6XPS3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TPTE2Q6XPS3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
TPTE2Q6XPS3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TPTE2Q6XPS3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
TPTE2Q6XPS3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TPTE2Q6XPS3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TPTE2Q6XPS3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TPTE2Q6XPS3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TPTE2Q6XPS3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TPTE2Q6XPS3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TPTE2Q6XPS3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TPTE2Q6XPS3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TPTE2Q6XPS3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TPTE2Q6XPS3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TPTE2Q6XPS3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TPTE2Q6XPS3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TPTE2Q6XPS3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TPTE2Q6XPS3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TPTE2Q6XPS3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TPTE2Q6XPS3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TPTE2Q6XPS3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TPTE2Q6XPS3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TPTE2Q6XPS3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TPTE2Q6XPS3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TPTE2Q6XPS3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TPTE2Q6XPS3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TPTE2Q6XPS3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TPTE2Q6XPS3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TPTE2Q6XPS3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TPTE2Q6XPS3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TPTE2Q6XPS3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TPTE2Q6XPS3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TPTE2Q6XPS3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TPTE2Q6XPS3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TPTE2Q6XPS3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TPTE2Q6XPS3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
TPTE2Q6XPS3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TPTE2Q6XPS3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TPTE2Q6XPS3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TPTE2Q6XPS3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TPTE2Q6XPS3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TPTE2Q6XPS3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TPTE2Q6XPS3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TPTE2Q6XPS3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TPTE2Q6XPS3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TPTE2Q6XPS3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TPTE2Q6XPS3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TPTE2Q6XPS3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TPTE2Q6XPS3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TPTE2Q6XPS3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TPTE2Q6XPS3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TPTE2Q6XPS3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TPTE2Q6XPS3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TPTE2Q6XPS3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TPTE2Q6XPS3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TPTE2Q6XPS3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TPTE2Q6XPS3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TPTE2Q6XPS3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TPTE2Q6XPS3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TPTE2Q6XPS3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TPTE2Q6XPS3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TPTE2Q6XPS3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TPTE2Q6XPS3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TPTE2Q6XPS3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TPTE2Q6XPS3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TPTE2Q6XPS3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TPTE2Q6XPS3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TPTE2Q6XPS3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TPTE2Q6XPS3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TPTE2Q6XPS3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TPTE2Q6XPS3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TPTE2Q6XPS3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TPTE2Q6XPS3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TPTE2Q6XPS3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TPTE2Q6XPS3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TPTE2Q6XPS3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TPTE2Q6XPS3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TPTE2Q6XPS3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TPTE2Q6XPS3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TPTE2Q6XPS3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TPTE2Q6XPS3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TPTE2Q6XPS3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TPTE2Q6XPS3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TPTE2Q6XPS3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms