Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CXCL17Q6UXB2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CXCL17Q6UXB2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CXCL17Q6UXB2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CXCL17Q6UXB2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CXCL17Q6UXB2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CXCL17Q6UXB2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CXCL17Q6UXB2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CXCL17Q6UXB2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CXCL17Q6UXB2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CXCL17Q6UXB2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CXCL17Q6UXB2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CXCL17Q6UXB2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CXCL17Q6UXB2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CXCL17Q6UXB2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CXCL17Q6UXB2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CXCL17Q6UXB2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CXCL17Q6UXB2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CXCL17Q6UXB2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CXCL17Q6UXB2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CXCL17Q6UXB2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CXCL17Q6UXB2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CXCL17Q6UXB2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CXCL17Q6UXB2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CXCL17Q6UXB2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CXCL17Q6UXB2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CXCL17Q6UXB2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CXCL17Q6UXB2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CXCL17Q6UXB2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CXCL17Q6UXB2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CXCL17Q6UXB2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CXCL17Q6UXB2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CXCL17Q6UXB2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CXCL17Q6UXB2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CXCL17Q6UXB2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CXCL17Q6UXB2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CXCL17Q6UXB2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CXCL17Q6UXB2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CXCL17Q6UXB2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CXCL17Q6UXB2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CXCL17Q6UXB2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CXCL17Q6UXB2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CXCL17Q6UXB2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CXCL17Q6UXB2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CXCL17Q6UXB2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CXCL17Q6UXB2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CXCL17Q6UXB2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CXCL17Q6UXB2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CXCL17Q6UXB2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CXCL17Q6UXB2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CXCL17Q6UXB2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CXCL17Q6UXB2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CXCL17Q6UXB2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CXCL17Q6UXB2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CXCL17Q6UXB2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CXCL17Q6UXB2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CXCL17Q6UXB2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CXCL17Q6UXB2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CXCL17Q6UXB2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CXCL17Q6UXB2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CXCL17Q6UXB2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CXCL17Q6UXB2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CXCL17Q6UXB2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CXCL17Q6UXB2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CXCL17Q6UXB2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CXCL17Q6UXB2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CXCL17Q6UXB2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CXCL17Q6UXB2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CXCL17Q6UXB2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CXCL17Q6UXB2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CXCL17Q6UXB2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CXCL17Q6UXB2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CXCL17Q6UXB2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CXCL17Q6UXB2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CXCL17Q6UXB2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CXCL17Q6UXB2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CXCL17Q6UXB2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CXCL17Q6UXB2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CXCL17Q6UXB2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CXCL17Q6UXB2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CXCL17Q6UXB2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CXCL17Q6UXB2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CXCL17Q6UXB2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CXCL17Q6UXB2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CXCL17Q6UXB2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CXCL17Q6UXB2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CXCL17Q6UXB2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CXCL17Q6UXB2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CXCL17Q6UXB2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CXCL17Q6UXB2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CXCL17Q6UXB2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CXCL17Q6UXB2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CXCL17Q6UXB2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CXCL17Q6UXB2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CXCL17Q6UXB2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CXCL17Q6UXB2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CXCL17Q6UXB2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CXCL17Q6UXB2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CXCL17Q6UXB2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CXCL17Q6UXB2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms