Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBA3EQ6PEY2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBA3EQ6PEY2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBA3EQ6PEY2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBA3EQ6PEY2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBA3EQ6PEY2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBA3EQ6PEY2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBA3EQ6PEY2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBA3EQ6PEY2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms