Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9G9

ZNF449, Zinc finger protein 449, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF449Q6P9G9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF449Q6P9G9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF449Q6P9G9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF449Q6P9G9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF449Q6P9G9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF449Q6P9G9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF449Q6P9G9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF449Q6P9G9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF449Q6P9G9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF449Q6P9G9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF449Q6P9G9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF449Q6P9G9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF449Q6P9G9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF449Q6P9G9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF449Q6P9G9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF449Q6P9G9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF449Q6P9G9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF449Q6P9G9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF449Q6P9G9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF449Q6P9G9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF449Q6P9G9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF449Q6P9G9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF449Q6P9G9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF449Q6P9G9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF449Q6P9G9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF449Q6P9G9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF449Q6P9G9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF449Q6P9G9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF449Q6P9G9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF449Q6P9G9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF449Q6P9G9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF449Q6P9G9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF449Q6P9G9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF449Q6P9G9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF449Q6P9G9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF449Q6P9G9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF449Q6P9G9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF449Q6P9G9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF449Q6P9G9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF449Q6P9G9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF449Q6P9G9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF449Q6P9G9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF449Q6P9G9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF449Q6P9G9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF449Q6P9G9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF449Q6P9G9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms