Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RNF123Q5XPI4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
RNF123Q5XPI4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RNF123Q5XPI4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RNF123Q5XPI4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RNF123Q5XPI4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RNF123Q5XPI4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RNF123Q5XPI4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RNF123Q5XPI4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RNF123Q5XPI4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RNF123Q5XPI4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RNF123Q5XPI4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RNF123Q5XPI4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
RNF123Q5XPI4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
RNF123Q5XPI4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RNF123Q5XPI4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RNF123Q5XPI4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RNF123Q5XPI4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RNF123Q5XPI4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RNF123Q5XPI4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RNF123Q5XPI4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RNF123Q5XPI4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RNF123Q5XPI4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RNF123Q5XPI4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RNF123Q5XPI4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RNF123Q5XPI4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RNF123Q5XPI4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RNF123Q5XPI4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RNF123Q5XPI4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RNF123Q5XPI4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RNF123Q5XPI4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RNF123Q5XPI4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RNF123Q5XPI4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RNF123Q5XPI4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RNF123Q5XPI4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
RNF123Q5XPI4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RNF123Q5XPI4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RNF123Q5XPI4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
RNF123Q5XPI4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RNF123Q5XPI4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
RNF123Q5XPI4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RNF123Q5XPI4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RNF123Q5XPI4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RNF123Q5XPI4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RNF123Q5XPI4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RNF123Q5XPI4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RNF123Q5XPI4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RNF123Q5XPI4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RNF123Q5XPI4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RNF123Q5XPI4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RNF123Q5XPI4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RNF123Q5XPI4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
RNF123Q5XPI4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RNF123Q5XPI4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RNF123Q5XPI4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RNF123Q5XPI4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.4 ms