Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
USPL1Q5W0Q7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
USPL1Q5W0Q7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
USPL1Q5W0Q7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
USPL1Q5W0Q7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
USPL1Q5W0Q7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
USPL1Q5W0Q7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
USPL1Q5W0Q7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
USPL1Q5W0Q7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
USPL1Q5W0Q7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
USPL1Q5W0Q7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
USPL1Q5W0Q7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
USPL1Q5W0Q7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
USPL1Q5W0Q7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
USPL1Q5W0Q7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
USPL1Q5W0Q7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
USPL1Q5W0Q7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
USPL1Q5W0Q7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
USPL1Q5W0Q7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USPL1Q5W0Q7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USPL1Q5W0Q7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
USPL1Q5W0Q7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
USPL1Q5W0Q7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USPL1Q5W0Q7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
USPL1Q5W0Q7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
USPL1Q5W0Q7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
USPL1Q5W0Q7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
USPL1Q5W0Q7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
USPL1Q5W0Q7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
USPL1Q5W0Q7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
USPL1Q5W0Q7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
USPL1Q5W0Q7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
USPL1Q5W0Q7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
USPL1Q5W0Q7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
USPL1Q5W0Q7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
USPL1Q5W0Q7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
USPL1Q5W0Q7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
USPL1Q5W0Q7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
USPL1Q5W0Q7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
USPL1Q5W0Q7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
USPL1Q5W0Q7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
USPL1Q5W0Q7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
USPL1Q5W0Q7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
USPL1Q5W0Q7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USPL1Q5W0Q7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
USPL1Q5W0Q7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USPL1Q5W0Q7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
USPL1Q5W0Q7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
USPL1Q5W0Q7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
USPL1Q5W0Q7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
USPL1Q5W0Q7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
USPL1Q5W0Q7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
USPL1Q5W0Q7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
USPL1Q5W0Q7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
USPL1Q5W0Q7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USPL1Q5W0Q7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USPL1Q5W0Q7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USPL1Q5W0Q7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USPL1Q5W0Q7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USPL1Q5W0Q7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USPL1Q5W0Q7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
USPL1Q5W0Q7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
USPL1Q5W0Q7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
USPL1Q5W0Q7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
USPL1Q5W0Q7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.37
USPL1Q5W0Q7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
USPL1Q5W0Q7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USPL1Q5W0Q7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USPL1Q5W0Q7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USPL1Q5W0Q7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USPL1Q5W0Q7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
USPL1Q5W0Q7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
USPL1Q5W0Q7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
USPL1Q5W0Q7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
USPL1Q5W0Q7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
USPL1Q5W0Q7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
USPL1Q5W0Q7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
USPL1Q5W0Q7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
USPL1Q5W0Q7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
USPL1Q5W0Q7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
USPL1Q5W0Q7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
USPL1Q5W0Q7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
USPL1Q5W0Q7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
USPL1Q5W0Q7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
USPL1Q5W0Q7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
USPL1Q5W0Q7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
USPL1Q5W0Q7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
USPL1Q5W0Q7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
USPL1Q5W0Q7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
USPL1Q5W0Q7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
USPL1Q5W0Q7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
USPL1Q5W0Q7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
USPL1Q5W0Q7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USPL1Q5W0Q7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
USPL1Q5W0Q7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
USPL1Q5W0Q7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
USPL1Q5W0Q7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USPL1Q5W0Q7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
USPL1Q5W0Q7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms