Protein–RNA interactions for Protein: Q56A73

SPIN4, Spindlin-4, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN4Q56A73 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPIN4Q56A73 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPIN4Q56A73 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SPIN4Q56A73 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPIN4Q56A73 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPIN4Q56A73 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPIN4Q56A73 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPIN4Q56A73 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPIN4Q56A73 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms