Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED5Q49AG3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED5Q49AG3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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