Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY17

SLC25A52, Solute carrier family 25 member 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A52Q3SY17 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC25A52Q3SY17 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC25A52Q3SY17 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC25A52Q3SY17 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC25A52Q3SY17 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC25A52Q3SY17 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC25A52Q3SY17 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC25A52Q3SY17 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC25A52Q3SY17 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC25A52Q3SY17 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC25A52Q3SY17 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC25A52Q3SY17 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC25A52Q3SY17 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC25A52Q3SY17 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC25A52Q3SY17 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC25A52Q3SY17 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC25A52Q3SY17 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC25A52Q3SY17 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC25A52Q3SY17 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC25A52Q3SY17 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC25A52Q3SY17 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC25A52Q3SY17 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC25A52Q3SY17 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC25A52Q3SY17 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC25A52Q3SY17 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC25A52Q3SY17 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC25A52Q3SY17 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC25A52Q3SY17 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC25A52Q3SY17 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC25A52Q3SY17 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC25A52Q3SY17 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC25A52Q3SY17 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC25A52Q3SY17 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC25A52Q3SY17 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC25A52Q3SY17 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC25A52Q3SY17 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC25A52Q3SY17 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC25A52Q3SY17 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC25A52Q3SY17 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC25A52Q3SY17 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC25A52Q3SY17 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC25A52Q3SY17 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC25A52Q3SY17 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC25A52Q3SY17 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC25A52Q3SY17 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC25A52Q3SY17 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC25A52Q3SY17 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC25A52Q3SY17 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC25A52Q3SY17 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC25A52Q3SY17 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC25A52Q3SY17 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC25A52Q3SY17 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC25A52Q3SY17 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC25A52Q3SY17 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC25A52Q3SY17 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC25A52Q3SY17 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC25A52Q3SY17 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC25A52Q3SY17 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC25A52Q3SY17 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC25A52Q3SY17 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC25A52Q3SY17 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC25A52Q3SY17 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC25A52Q3SY17 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC25A52Q3SY17 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC25A52Q3SY17 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC25A52Q3SY17 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC25A52Q3SY17 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC25A52Q3SY17 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC25A52Q3SY17 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC25A52Q3SY17 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC25A52Q3SY17 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC25A52Q3SY17 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC25A52Q3SY17 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC25A52Q3SY17 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC25A52Q3SY17 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC25A52Q3SY17 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC25A52Q3SY17 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC25A52Q3SY17 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC25A52Q3SY17 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC25A52Q3SY17 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC25A52Q3SY17 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC25A52Q3SY17 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC25A52Q3SY17 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC25A52Q3SY17 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC25A52Q3SY17 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC25A52Q3SY17 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC25A52Q3SY17 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC25A52Q3SY17 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC25A52Q3SY17 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC25A52Q3SY17 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC25A52Q3SY17 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC25A52Q3SY17 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC25A52Q3SY17 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC25A52Q3SY17 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC25A52Q3SY17 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC25A52Q3SY17 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC25A52Q3SY17 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC25A52Q3SY17 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC25A52Q3SY17 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC25A52Q3SY17 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms