Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00303Q3SY05 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00303Q3SY05 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00303Q3SY05 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00303Q3SY05 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00303Q3SY05 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00303Q3SY05 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00303Q3SY05 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00303Q3SY05 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00303Q3SY05 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00303Q3SY05 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00303Q3SY05 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00303Q3SY05 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00303Q3SY05 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00303Q3SY05 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00303Q3SY05 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00303Q3SY05 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00303Q3SY05 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00303Q3SY05 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms