Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKN1Q16512 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKN1Q16512 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKN1Q16512 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKN1Q16512 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKN1Q16512 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKN1Q16512 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PKN1Q16512 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKN1Q16512 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKN1Q16512 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKN1Q16512 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKN1Q16512 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKN1Q16512 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKN1Q16512 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKN1Q16512 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKN1Q16512 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKN1Q16512 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKN1Q16512 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKN1Q16512 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PKN1Q16512 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PKN1Q16512 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PKN1Q16512 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PKN1Q16512 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PKN1Q16512 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PKN1Q16512 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PKN1Q16512 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PKN1Q16512 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PKN1Q16512 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PKN1Q16512 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PKN1Q16512 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PKN1Q16512 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKN1Q16512 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKN1Q16512 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKN1Q16512 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PKN1Q16512 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKN1Q16512 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKN1Q16512 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PKN1Q16512 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PKN1Q16512 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PKN1Q16512 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PKN1Q16512 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PKN1Q16512 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PKN1Q16512 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PKN1Q16512 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PKN1Q16512 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PKN1Q16512 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PKN1Q16512 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PKN1Q16512 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PKN1Q16512 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PKN1Q16512 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PKN1Q16512 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PKN1Q16512 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PKN1Q16512 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PKN1Q16512 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PKN1Q16512 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PKN1Q16512 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PKN1Q16512 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKN1Q16512 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKN1Q16512 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKN1Q16512 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKN1Q16512 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKN1Q16512 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PKN1Q16512 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKN1Q16512 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PKN1Q16512 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKN1Q16512 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKN1Q16512 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKN1Q16512 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PKN1Q16512 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKN1Q16512 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKN1Q16512 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKN1Q16512 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKN1Q16512 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKN1Q16512 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKN1Q16512 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKN1Q16512 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKN1Q16512 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKN1Q16512 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKN1Q16512 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKN1Q16512 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKN1Q16512 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKN1Q16512 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKN1Q16512 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKN1Q16512 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKN1Q16512 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKN1Q16512 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKN1Q16512 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKN1Q16512 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PKN1Q16512 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PKN1Q16512 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKN1Q16512 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKN1Q16512 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PKN1Q16512 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKN1Q16512 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKN1Q16512 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PKN1Q16512 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PKN1Q16512 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PKN1Q16512 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PKN1Q16512 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PKN1Q16512 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
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