Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA1EQ15878 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA1EQ15878 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA1EQ15878 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA1EQ15878 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA1EQ15878 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA1EQ15878 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA1EQ15878 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA1EQ15878 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA1EQ15878 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA1EQ15878 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA1EQ15878 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA1EQ15878 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA1EQ15878 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA1EQ15878 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1EQ15878 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1EQ15878 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1EQ15878 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1EQ15878 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1EQ15878 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1EQ15878 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1EQ15878 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1EQ15878 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1EQ15878 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1EQ15878 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1EQ15878 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1EQ15878 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA1EQ15878 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA1EQ15878 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA1EQ15878 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA1EQ15878 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA1EQ15878 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA1EQ15878 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1EQ15878 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1EQ15878 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1EQ15878 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1EQ15878 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1EQ15878 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1EQ15878 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1EQ15878 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1EQ15878 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1EQ15878 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1EQ15878 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1EQ15878 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1EQ15878 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1EQ15878 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1EQ15878 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1EQ15878 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1EQ15878 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1EQ15878 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1EQ15878 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1EQ15878 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1EQ15878 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA1EQ15878 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA1EQ15878 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA1EQ15878 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA1EQ15878 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA1EQ15878 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA1EQ15878 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA1EQ15878 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA1EQ15878 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1EQ15878 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1EQ15878 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1EQ15878 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1EQ15878 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1EQ15878 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1EQ15878 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1EQ15878 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1EQ15878 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA1EQ15878 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA1EQ15878 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA1EQ15878 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA1EQ15878 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CACNA1EQ15878 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CACNA1EQ15878 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CACNA1EQ15878 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CACNA1EQ15878 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CACNA1EQ15878 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1EQ15878 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1EQ15878 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1EQ15878 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1EQ15878 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1EQ15878 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA1EQ15878 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA1EQ15878 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA1EQ15878 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA1EQ15878 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA1EQ15878 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA1EQ15878 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA1EQ15878 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1EQ15878 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1EQ15878 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1EQ15878 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1EQ15878 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1EQ15878 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1EQ15878 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA1EQ15878 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA1EQ15878 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA1EQ15878 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA1EQ15878 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms