Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDSNQ15517 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDSNQ15517 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDSNQ15517 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDSNQ15517 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDSNQ15517 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDSNQ15517 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDSNQ15517 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDSNQ15517 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CDSNQ15517 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDSNQ15517 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDSNQ15517 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDSNQ15517 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDSNQ15517 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDSNQ15517 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDSNQ15517 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDSNQ15517 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CDSNQ15517 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDSNQ15517 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDSNQ15517 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDSNQ15517 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDSNQ15517 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDSNQ15517 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDSNQ15517 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDSNQ15517 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDSNQ15517 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CDSNQ15517 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDSNQ15517 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDSNQ15517 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDSNQ15517 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDSNQ15517 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDSNQ15517 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDSNQ15517 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDSNQ15517 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDSNQ15517 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDSNQ15517 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDSNQ15517 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDSNQ15517 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDSNQ15517 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDSNQ15517 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDSNQ15517 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDSNQ15517 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDSNQ15517 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CDSNQ15517 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDSNQ15517 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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