Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VGLL4Q14135 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VGLL4Q14135 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
VGLL4Q14135 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VGLL4Q14135 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VGLL4Q14135 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VGLL4Q14135 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VGLL4Q14135 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VGLL4Q14135 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VGLL4Q14135 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VGLL4Q14135 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VGLL4Q14135 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VGLL4Q14135 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VGLL4Q14135 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VGLL4Q14135 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VGLL4Q14135 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VGLL4Q14135 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VGLL4Q14135 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VGLL4Q14135 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VGLL4Q14135 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VGLL4Q14135 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VGLL4Q14135 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VGLL4Q14135 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
VGLL4Q14135 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
VGLL4Q14135 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VGLL4Q14135 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VGLL4Q14135 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VGLL4Q14135 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VGLL4Q14135 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VGLL4Q14135 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
VGLL4Q14135 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VGLL4Q14135 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VGLL4Q14135 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VGLL4Q14135 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VGLL4Q14135 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VGLL4Q14135 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VGLL4Q14135 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VGLL4Q14135 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VGLL4Q14135 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VGLL4Q14135 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VGLL4Q14135 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VGLL4Q14135 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VGLL4Q14135 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VGLL4Q14135 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VGLL4Q14135 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VGLL4Q14135 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
VGLL4Q14135 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VGLL4Q14135 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
VGLL4Q14135 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VGLL4Q14135 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VGLL4Q14135 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VGLL4Q14135 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VGLL4Q14135 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VGLL4Q14135 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VGLL4Q14135 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
VGLL4Q14135 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VGLL4Q14135 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
VGLL4Q14135 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VGLL4Q14135 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VGLL4Q14135 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VGLL4Q14135 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
VGLL4Q14135 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VGLL4Q14135 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VGLL4Q14135 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VGLL4Q14135 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VGLL4Q14135 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VGLL4Q14135 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VGLL4Q14135 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VGLL4Q14135 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VGLL4Q14135 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VGLL4Q14135 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
VGLL4Q14135 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VGLL4Q14135 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
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VGLL4Q14135 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.57■■■□□ 2
VGLL4Q14135 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
VGLL4Q14135 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VGLL4Q14135 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VGLL4Q14135 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VGLL4Q14135 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
VGLL4Q14135 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
VGLL4Q14135 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VGLL4Q14135 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VGLL4Q14135 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VGLL4Q14135 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VGLL4Q14135 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
VGLL4Q14135 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
VGLL4Q14135 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
VGLL4Q14135 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
VGLL4Q14135 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VGLL4Q14135 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.53■■■□□ 2
VGLL4Q14135 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
VGLL4Q14135 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.53■■■□□ 2
VGLL4Q14135 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
VGLL4Q14135 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
VGLL4Q14135 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VGLL4Q14135 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
VGLL4Q14135 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
VGLL4Q14135 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
VGLL4Q14135 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
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