Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP1A4Q13733 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP1A4Q13733 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
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