Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRSF6Q13247 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRSF6Q13247 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRSF6Q13247 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRSF6Q13247 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRSF6Q13247 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRSF6Q13247 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRSF6Q13247 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF6Q13247 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF6Q13247 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF6Q13247 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF6Q13247 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF6Q13247 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF6Q13247 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF6Q13247 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF6Q13247 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF6Q13247 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF6Q13247 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF6Q13247 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRSF6Q13247 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRSF6Q13247 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SRSF6Q13247 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRSF6Q13247 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SRSF6Q13247 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SRSF6Q13247 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRSF6Q13247 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRSF6Q13247 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
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