Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BNIP3Q12983 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BNIP3Q12983 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BNIP3Q12983 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BNIP3Q12983 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BNIP3Q12983 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BNIP3Q12983 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BNIP3Q12983 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BNIP3Q12983 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BNIP3Q12983 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BNIP3Q12983 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BNIP3Q12983 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BNIP3Q12983 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BNIP3Q12983 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BNIP3Q12983 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BNIP3Q12983 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BNIP3Q12983 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BNIP3Q12983 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BNIP3Q12983 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BNIP3Q12983 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BNIP3Q12983 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BNIP3Q12983 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BNIP3Q12983 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BNIP3Q12983 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BNIP3Q12983 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BNIP3Q12983 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BNIP3Q12983 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BNIP3Q12983 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BNIP3Q12983 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BNIP3Q12983 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BNIP3Q12983 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BNIP3Q12983 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BNIP3Q12983 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BNIP3Q12983 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BNIP3Q12983 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BNIP3Q12983 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BNIP3Q12983 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BNIP3Q12983 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BNIP3Q12983 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BNIP3Q12983 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BNIP3Q12983 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BNIP3Q12983 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BNIP3Q12983 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNIP3Q12983 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNIP3Q12983 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNIP3Q12983 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNIP3Q12983 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNIP3Q12983 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNIP3Q12983 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNIP3Q12983 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNIP3Q12983 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BNIP3Q12983 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms