Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCNT1Q02742 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCNT1Q02742 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCNT1Q02742 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCNT1Q02742 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCNT1Q02742 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCNT1Q02742 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCNT1Q02742 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCNT1Q02742 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GCNT1Q02742 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCNT1Q02742 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCNT1Q02742 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCNT1Q02742 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCNT1Q02742 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCNT1Q02742 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCNT1Q02742 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GCNT1Q02742 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCNT1Q02742 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCNT1Q02742 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCNT1Q02742 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCNT1Q02742 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCNT1Q02742 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCNT1Q02742 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCNT1Q02742 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCNT1Q02742 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCNT1Q02742 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCNT1Q02742 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCNT1Q02742 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCNT1Q02742 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCNT1Q02742 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCNT1Q02742 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCNT1Q02742 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCNT1Q02742 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCNT1Q02742 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCNT1Q02742 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GCNT1Q02742 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCNT1Q02742 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms