Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ASIC1P78348 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ASIC1P78348 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ASIC1P78348 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ASIC1P78348 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ASIC1P78348 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ASIC1P78348 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ASIC1P78348 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ASIC1P78348 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ASIC1P78348 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ASIC1P78348 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ASIC1P78348 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ASIC1P78348 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ASIC1P78348 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ASIC1P78348 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ASIC1P78348 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ASIC1P78348 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ASIC1P78348 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ASIC1P78348 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ASIC1P78348 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ASIC1P78348 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ASIC1P78348 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ASIC1P78348 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ASIC1P78348 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ASIC1P78348 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ASIC1P78348 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ASIC1P78348 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ASIC1P78348 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ASIC1P78348 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ASIC1P78348 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ASIC1P78348 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ASIC1P78348 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ASIC1P78348 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ASIC1P78348 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ASIC1P78348 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ASIC1P78348 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ASIC1P78348 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ASIC1P78348 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ASIC1P78348 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ASIC1P78348 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ASIC1P78348 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ASIC1P78348 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ASIC1P78348 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ASIC1P78348 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ASIC1P78348 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ASIC1P78348 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms