Protein–RNA interactions for Protein: P52738

ZNF140, Zinc finger protein 140, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF140P52738 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF140P52738 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF140P52738 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF140P52738 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF140P52738 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF140P52738 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF140P52738 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF140P52738 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF140P52738 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF140P52738 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF140P52738 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF140P52738 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms