Protein–RNA interactions for Protein: P49721

PSMB2, Proteasome subunit beta type-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB2P49721 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB2P49721 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms