Protein–RNA interactions for Protein: P48553

TRAPPC10, Trafficking protein particle complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10P48553 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC10P48553 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC10P48553 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC10P48553 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC10P48553 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC10P48553 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC10P48553 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC10P48553 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC10P48553 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC10P48553 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC10P48553 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC10P48553 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC10P48553 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC10P48553 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC10P48553 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC10P48553 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC10P48553 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC10P48553 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC10P48553 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC10P48553 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC10P48553 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC10P48553 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC10P48553 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC10P48553 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC10P48553 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC10P48553 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC10P48553 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRAPPC10P48553 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRAPPC10P48553 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRAPPC10P48553 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRAPPC10P48553 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC10P48553 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms