Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AFMP43652 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
AFMP43652 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
AFMP43652 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
AFMP43652 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
AFMP43652 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
AFMP43652 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
AFMP43652 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
AFMP43652 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
AFMP43652 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
AFMP43652 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AFMP43652 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AFMP43652 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AFMP43652 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AFMP43652 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AFMP43652 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AFMP43652 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AFMP43652 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AFMP43652 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AFMP43652 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AFMP43652 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AFMP43652 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AFMP43652 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AFMP43652 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AFMP43652 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
AFMP43652 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AFMP43652 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AFMP43652 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AFMP43652 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AFMP43652 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AFMP43652 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AFMP43652 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AFMP43652 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AFMP43652 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AFMP43652 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AFMP43652 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AFMP43652 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AFMP43652 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AFMP43652 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AFMP43652 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
AFMP43652 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AFMP43652 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
AFMP43652 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
AFMP43652 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AFMP43652 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AFMP43652 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
AFMP43652 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AFMP43652 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
AFMP43652 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
AFMP43652 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AFMP43652 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
AFMP43652 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AFMP43652 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AFMP43652 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AFMP43652 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AFMP43652 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AFMP43652 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AFMP43652 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AFMP43652 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AFMP43652 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AFMP43652 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
AFMP43652 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
AFMP43652 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AFMP43652 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AFMP43652 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AFMP43652 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AFMP43652 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AFMP43652 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AFMP43652 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AFMP43652 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AFMP43652 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AFMP43652 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AFMP43652 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AFMP43652 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AFMP43652 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AFMP43652 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AFMP43652 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AFMP43652 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AFMP43652 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AFMP43652 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AFMP43652 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AFMP43652 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AFMP43652 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AFMP43652 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AFMP43652 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AFMP43652 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AFMP43652 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AFMP43652 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
AFMP43652 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AFMP43652 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AFMP43652 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
AFMP43652 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
AFMP43652 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
AFMP43652 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AFMP43652 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
AFMP43652 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AFMP43652 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AFMP43652 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AFMP43652 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
AFMP43652 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms