Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIA1P42261 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIA1P42261 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIA1P42261 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIA1P42261 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIA1P42261 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIA1P42261 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIA1P42261 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIA1P42261 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIA1P42261 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIA1P42261 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIA1P42261 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIA1P42261 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIA1P42261 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIA1P42261 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIA1P42261 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIA1P42261 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIA1P42261 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIA1P42261 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIA1P42261 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIA1P42261 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIA1P42261 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIA1P42261 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIA1P42261 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIA1P42261 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIA1P42261 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIA1P42261 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIA1P42261 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIA1P42261 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIA1P42261 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIA1P42261 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIA1P42261 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIA1P42261 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIA1P42261 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIA1P42261 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIA1P42261 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIA1P42261 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIA1P42261 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIA1P42261 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIA1P42261 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIA1P42261 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIA1P42261 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIA1P42261 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GRIA1P42261 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GRIA1P42261 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms